1993年，"上海市科协第五届青年优秀科技论文一等奖"

1997年，中国科学技术协会第五届“中国青年科技奖”

1998年，自然科学基金化学学部“国家杰出青年科学基金”

1999年，“教育部科学技术进步一等奖”（第二完成人）

1999年，国家重点基础研究发展规划项目（973）——“组织工程的基本科学问题”有关生物材料的子课题负责人

2000年，教育部首届“青年教师奖”

2001年，第七届“上海市科技精英提名奖”

2001年，国家重点高技术发展项目（S863）——“新型蛋白质药物缓释载体”项目负责人

2002年3月，和杨玉良教授联合指导的一篇硕士学位论文被上海市教育委员会和上海市学位委员会联合授予“上海市研究生优秀成果（学位论文）”

2002年，“中国高校自然科学一等奖”（第二完成人）

l2003年11月，博士生张俊川和朱文分别获得“上海市大学生发明专利奖”二等奖（申请号：01126477.2）和三等奖（申请号：03115319.4）

2004年7月，会议论文“一种新型的智能化可降解水凝胶以及作为蛋白质药物通用缓释载体的初步研究”（丁建东等）获得“2004中国药学会学术年会三等奖”（会议收到投稿近900篇，评出各类获奖论文共57篇）